Naujojo koronaviruso biomarkeriai
Naujasis koronavirusas yra RNR virusas, sudarytas iš baltymų ir nukleino rūgščių.Virusas įsiskverbia į šeimininko (žmogaus) kūną, patenka į ląsteles per atitinkamą receptorių ACE2 jungimosi vietą ir dauginasi ląstelėse-šeimininkėse, todėl žmogaus imuninė sistema reaguoja į svetimus įsibrovėlius ir gamina specifinius antikūnus.Todėl buteliuke esančios nukleorūgštys ir antigenai bei specifiniai antikūnai prieš naująjį koronavirusą teoriškai gali būti naudojami kaip specifiniai biomarkeriai naujam koronavirusui aptikti.Nukleino rūgštims aptikti dažniausiai naudojama RT-PGR technologija, o serologiniai metodai dažniausiai naudojami naujiems koronaviruso specifiniams antikūnams aptikti.Šiuo metu yra įvairių testavimo metodų, kuriuos galime pasirinkti COVID-19 infekcijai tirti [1].

Pagrindiniai pagrindinių naujojo koronaviruso tyrimo metodų principai
Iki šiol galima atlikti daugybę COVID_19 diagnostinių testų, o kasdien vis daugiau testų rinkinių patvirtinama pagal leidimą naudoti kritiniu atveju.Nors nauji bandymai pateikiami su tiek daug skirtingų pavadinimų ir formatų, visi dabartiniai COVID_19 testai iš esmės remiasi dviem pagrindinėmis technologijomis: viruso RNR aptikimu ir serologiniais imuniniais tyrimais, aptinkančiais virusui specifinius antikūnus (IgM ir IgG).

01. Nukleino rūgščių aptikimas
Atvirkštinės transkripcijos polimerazės grandininė reakcija (RT-PCR), kilpos tarpininkaujama izoterminė amplifikacija (LAMP) ir naujos kartos sekos nustatymas (NGS) yra įprasti nukleino rūgščių metodai, skirti aptikti naują koronaviruso RNR.RT-PGR yra pirmasis COVID-19 testas, kurį rekomenduoja ir Pasaulio sveikatos organizacija (PSO), ir JAV Ligų kontrolės ir prevencijos centras (CDC).

02.Serologinis antikūnų nustatymas
Antikūnas yra apsauginis baltymas, kuris susidaro žmogaus organizme reaguojant į viruso infekciją.IgM yra ankstyvas antikūnų tipas, o IgG yra vėlesnio tipo antikūnas.Serumo arba plazmos mėginys paprastai tiriamas, ar nėra specifinių IgM ir IgG tipų antikūnų, siekiant įvertinti ūmią ir sveikstančią COVID-19 infekcijos fazes.Šie antikūnais pagrįsti aptikimo metodai apima koloidinio aukso imunochromatografijos tyrimą, latekso arba fluorescencinės mikrosferos imunochromatografiją, su fermentu susietą imunosorbentinį tyrimą (ELISA) ir chemiliuminescencinį tyrimą.

03. Viruso antigeno nustatymas
Antigenas yra žmogaus kūno atpažįstama viruso struktūra, kuri skatina imuninę gynybos sistemą gaminti antikūnus, kad pašalintų virusą iš kraujo ir audinių.Viruso antigenas, esantis ant viruso, gali būti nukreiptas ir aptiktas naudojant imunologinį tyrimą.Kaip ir viruso RNR, viruso antigenų taip pat yra užsikrėtusių asmenų kvėpavimo takuose ir jie gali būti naudojami diagnozuojant ūminę COVID-19 infekcijos fazę.Todėl dažnai rekomenduojama paimti viršutinių kvėpavimo takų mėginius, pvz., seilių, nosiaryklės ir burnos ir ryklės tepinėlių, gilaus kosulio skreplių, bronchoalveolinio plovimo skysčio (BALF) pirminiam antigenų tyrimui.

Naujojo koronaviruso tyrimo metodų parinkimas
Renkantis tyrimo metodą atsižvelgiama į daugelį veiksnių, įskaitant klinikinę aplinką, tyrimų kokybės kontrolę, atlikimo laiką, tyrimo išlaidas, mėginių ėmimo metodus, laboratorijos personalo techninius reikalavimus, įrangos ir įrangos reikalavimus.Nukleino rūgščių arba viruso antigenų aptikimas turi pateikti tiesioginius virusų buvimo įrodymus ir patvirtinti naujos koronavirusinės infekcijos diagnozę.Nors yra daug antigenų aptikimo metodų, jų aptikimo jautrumas naujojo koronaviruso atveju teoriškai yra mažesnis nei RT-PGR amplifikacijos.Antikūnų tyrimas – tai žmogaus organizme gaminamų antivirusinių antikūnų nustatymas, kuris vėluoja laiku ir dažnai negali būti naudojamas ankstyvam aptikimui ūminės virusinės infekcijos fazės metu.Klinikinė aptikimo programa gali skirtis, o mėginių paėmimo vietos taip pat gali skirtis.Norint aptikti virusines nukleino rūgštis ir antigenus, mėginius reikia paimti iš kvėpavimo takų, kuriuose yra viruso, pvz., nosiaryklės, burnos ir ryklės tepinėlių, skreplių arba bronchoalveolinio plovimo skysčio (BALF).Norint nustatyti antikūnus, reikia paimti kraujo mėginį ir ištirti, ar nėra specifinio antivirusinio antikūno (IgM/IgG).Tačiau antikūnų ir nukleorūgščių tyrimų rezultatai gali papildyti vienas kitą.Pavyzdžiui, kai tyrimo rezultatas yra neigiamas nukleorūgštis, IgM neigiamas, bet IgG teigiamas, šie rezultatai rodo, kad pacientas šiuo metu viruso nenešioja, bet yra pasveikęs nuo naujos koronaviruso infekcijos.[2]

Naujų koronaviruso testų privalumai ir trūkumai
Naujojo koronaviruso pneumonijos diagnostikos ir gydymo protokole (7 bandomoji versija) (2020 m. kovo 3 d. Nacionalinės sveikatos komisijos ir Valstybinės tradicinės kinų medicinos administracijos išleido) nukleino rūgščių tyrimas naudojamas kaip auksinis standartas naujojo diagnozei nustatyti. koronaviruso infekcija, o antikūnų tyrimas taip pat laikomas vienu iš diagnozės patvirtinimo metodų.

Patogeniniai ir serologiniai radiniai
(1) Patogeniniai radiniai: naudojant RT-PCR ir (arba) NGS metodus, naujos koronaviruso nukleino rūgšties galima aptikti nosiaryklės tamponuose, skrepliuose, apatinių kvėpavimo takų sekretuose, kraujyje, išmatose ir kituose mėginiuose.Tiksliau, jei mėginiai paimti iš apatinių kvėpavimo takų (skreplių arba oro takų ištraukimo).Mėginiai turi būti pateikti tyrimui kuo greičiau po paėmimo.
(2) Serologiniai radiniai: NCP virusui specifinis IgM aptinkamas praėjus maždaug 3–5 dienoms po pasireiškimo;IgG titruoja mažiausiai 4 kartus sveikstant, palyginti su ūmine faze.

Tačiau tyrimo metodų pasirinkimas priklauso nuo geografinių vietų, medicininių taisyklių ir klinikinių sąlygų.JAV NIH paskelbė 2019 m. koronaviruso ligos (COVID-19) gydymo gaires (svetainė atnaujinta: 2020 m. balandžio 21 d.), o FDA išleido 2019 m. koronavirusinės ligos diagnostinių testų politiką ekstremalios visuomenės sveikatos atveju (išleista 2020 m. kovo 16 d. ), kuriame serologinis IgM/IgG antikūnų tyrimas buvo pasirinktas tik kaip atrankos testas.